Stoffschutz ist ein Begriff aus dem Patentrecht, insbesondere im Zusammenhang mit Chemie-Patenten.
In einem Patent führt ein erteilter Anspruch auf eine chemische Verbindung zum Schutz dieses Stoffes unabhängig davon, für welche Verwendung er vorgesehen ist. Damit ist für die Patentlaufzeit des Stoffschutzes zugleich auch eine Verwendung dieses Stoffes für eine alternative, neue Verwendung der chemischen Verbindung blockiert, auch wenn diese neue Verwendung dem Erfinder des Stoffes bei der Anmeldung seiner Erfindung gar nicht bekannt war. Der Stoffschutz ist besonders beim Patentschutz neuer Arzneistoffe in der Pharmazie und Wirkstoffen von Pflanzenschutzmitteln von erheblicher praktischer und wirtschaftlicher Bedeutung. Wenn ein Patent einen Stoffschutz beinhaltet, ist es für den Patentanmelder relativ einfach, einem vermeintlichen Patentverletzer die Patentverletzung präzise mit den Methoden der analytischen Chemie nachzuweisen.